研究室紹介
2番じゃダメですか、の問いかけで一躍知名度が上がったスーパーコンピューター「京」。その用途の一つにウイルスのシミュレーションがあります。シミュレーションとは、「模擬」や「まね」のことであり、これは計算機の上でウイルスを原子の集合体として表し、原子間の結合のあり方を原子に作用する力として計算で求め、ウイルスの構造(つまり原子配置)やその運動を、原子の集合体の運動として表そうという試みで、これを計算機による「まね」と称しているわけです。このようなシミュレーションの方法を分子シミュレーションと呼んでおり、2013年のノーベル化学賞もこのような研究に深く関わっています。近年、分子シミュレーションは理論や実験では容易に手の届かない原子レベルでの現象の解明に有用な手法として急速に発展しつつあります。